计算机审计的基本过程与传统审计是一致的，同样可以分为审计准备阶段、审计实施阶段和审计终结阶段。
　　1.审计准备阶段
　　审计前，应在对被审计单位组织机构进行调查的基础上，摸清计算机在组织机构内部的分布和应用的总体情况。然后再根据审计目标和重要性程度确定应该详细调查的子系统。在确定数据需求的基础上，通过可行的技术手段采集所需要的会计和业务的完整数据，掌握被审计单位的整体信息。
　　对所采集数据进行清理、转换和验证等一系列操作，在保证数据的真实性、完整性、正确性的基础上，获得适合审计需要的数据。
　　2.审计实施阶段
　　审计人员可以通过对数据表进行连接、投影等操作，生成满足分析的“审计中间表”，为下一步的审计分析打下基础。
　　在通过审计模型进行数据分析的过程中，有可能直接发现和查实问题，也有可能发现问题的线索。针对不同的情况，在延伸的时候可以采取直接取证或进一步核查的方式取证，验证和查实问题。
　　3.审计终结阶段
　　如果数据分析的结果能够直接查实问题，审计人员应该对电子数据进行直接取证，对于不能直接查实的问题，应根据线索进行延伸审计，获取相关证明材料。
　　对所有的证明材料和底稿，审计人员在编制审计报告时，应进行归纳总结，提出自己的审计意见，结合审计方案和重点形成审计报告。